Thanh bên bài viết
Số lượt xem pdf: 2
ỨNG DỤNG KỸ THUẬT REAL-TIME PCR XÁC ĐỊNH SỐ LƯỢNG BẢN SAO TY THỂ TỪ MẪU MÔ FFPE
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Ty thể là bào quan của tế bào nhân thực, chịu trách nhiệm cho việc tạo ra năng lượng. Bộ gen ty thể có cấu trúc phân tử DNA dạng vòng, dài 16569 cặp base chứa 37 gen mã hóa cho 13 protein, 22 tRNA, và 2 rRNA. Mỗi ty thể có thể chứa hàng trăm đến hàng ngàn bản sao, tùy thuộc vào loại tế bào. Tuy nhiên, sự thay đổi số lượng bản sao của DNA ty thể (mtDNA-CN) đã được chứng minh có liên quan với các trạng thái bệnh lý khác nhau bao gồm cả ung thư. Các mô cố định bằng formalin, đúc paraffin (FFPE) là nguồn vật liệu quý để chẩn đoán, nghiên cứu quá trình sinh bệnh của ung thư. Tuy nhiên, DNA được tách chiết từ các mô FFPE bị phân hủy mạnh do liên kết chéo giữa các sợi axit nucleic. Real-time PCR (Real-time PCR) là phương pháp tiêu chuẩn vàng để đo lường mtDNA-CN. Trong nghiên cứu này, chúng tôi thiết lập một phương pháp Real-time PCR sử dụng SYBR Green đơn giản để xác định mtDNA-CN từ những mẫu FFPE
Chi tiết bài viết
Từ khóa
ty thể, mẫu FFPE, Real-time PCR
Tài liệu tham khảo
2. Dedhia P, Tarale S, Dhongde G, Khadapkar R, et al. Evaluation of DNA extraction methods and real time PCR optimization on formalin-fixed paraffin-embedded tissues. Asian Pac J Cancer. 2007;8(1):55–59.
3. Christopher B. Jackson, Sabina Gallati, André Schaller. qPCR-based mitochondrial DNA quantification: Influence of template DNA fragmentation on accuracy. Biochemical and Biophysical Research Communications. Volume 423, Issue 3, 2012, 441-447,
4. Bai RK, Chang J, Yeh KT, Lou MA, Lu JF, Tan DJ, et al. Mitochondrial DNA Content Varies with Pathological Characteristics of Breast Cancer. Journal of Oncology. 2011;2011:1–10.
5. Alejandro Alegría Torres J. The mitochondrial DNA copy number used as biomarker. Int J Mol Biol Open Access. 2018;3(3):117–119
6. Birch-Machin MA. Using mitochondrial DNA as a biosensor of early cancer development. Br J Cancer. 2005 Aug;93(3):271–2.
7. Font A, Tort F, Navarro-Sastre A, Cusí V, García-Villoria J, Briones P, Ribes A. Quantitative Analysis of mtDNA Content in Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Muscle Tissue. JIMD Rep. 2011;1:125-9.
8. S. Cardoso, Z.S. Quintero-Niño, X. Elcoroaristizabal, I. Guerra-Merino, M.M. de Pancorbo, Mitochondrial DNA analysis of formalin-fixed paraffin-embedded tissue samples: Effect of formalin on DNA stability and its implications in genetic studies. Forensic Science International: Genetics Supplement Series. Volume 3, Issue 1, 2011, e518-e519.