XÂY DỰNG QUY TRÌNH ASO PCR XÁC ĐỊNH ĐIỂM ĐA HÌNH ĐƠN R1628P TRÊN GEN LRRK2

Lê Gia Hoàng Linh1, Mai Phương Thảo1,
1 Đại học Y Dược Thành Phố Hồ Chí Minh

Nội dung chính của bài viết

Tóm tắt

Đặt vấn đề: Bệnh Parkinson (PD) là một rối loạn thoái hóa thần kinh phổ biến, đặc trưng bởi các triệu chứng run, cứng cơ và giảm vận động, do mất dần các tế bào thần kinh tiết dopamine ở phần đặc chất đen của não bộ. Biến thể R1628P trên gen LRRK2 là một yếu tố nguy cơ đáng kể đối với PD ở các quần thể người châu Á, đặc biệt là người Trung Quốc và Thái Lan. Nghiên cứu về biến thể này giúp hiểu rõ hơn về cơ chế bệnh sinh của PD. Mục tiêu: Xây dựng và tối ưu hóa quy trình ASO-PCR để xác định biến thể R1628P trên gen LRRK2, đồng thời khảo sát tần suất của biến thể này ở đối tượng không mắc bệnh Parkinson. Đối tượng – Phương pháp nghiên cứu: Nghiên cứu được thực hiện trên 200 mẫu DNA đã thu thập trước đó. Quy trình ASO-PCR sử dụng cặp mồi đặc hiệu cho các alen G và C của biến thể R1628P, với các thông số nhiệt độ tối ưu để tăng độ nhạy và độ đặc hiệu của kỹ thuật. Kết quả: Quy trình ASO-PCR cho thấy độ đặc hiệu cao khi phát hiện kiểu gen của các mẫu, với tần suất biến thể R1628P là 3,5%, trong đó có 7 mẫu mang kiểu gen G/C và 193 mẫu mang kiểu gen G/G. Kết quả xác định kiểu gen của phương pháp ASO-PCR trùng khớp với kết quả của phương pháp giải trình tự Sanger. Kết luận: Kỹ thuật ASO-PCR là công cụ hiệu quả để xác định biến thể R1628P, cung cấp một phương pháp có độ chính xác cao cho các nghiên cứu tần suất và nguy cơ di truyền liên quan đến bệnh Parkinson.

Chi tiết bài viết

Tài liệu tham khảo

Pulkes, T., et al., Confirmation of the association between LRRK2 R1628P variant and susceptibility to Parkinson's disease in the Thai population. Parkinsonism Relat Disord, 2014. 20(9): p. 1018-21.
2. Zhang, P., et al., Association of LRRK2 R1628P variant with Parkinson's disease in Ethnic Han-Chinese and subgroup population. Sci Rep, 2016. 6: p. 35171.
3. Do, M.D., et al., Clinical and genetic analysis of Vietnamese patients diagnosed with early-onset Parkinson's disease. Brain Behav, 2023. 13(4): p. e2950.
4. Wu, Y.-R., et al., Genetic variants of LRRK2 in Taiwanese Parkinson’s disease. PloS one, 2013. 8(12): p. e82001.
5. Zhao, H. and Z. Kong, Relationship between LRRK2 R1628P polymorphism and Parkinson's disease in Asian populations. Oncotarget, 2016. 7(30): p. 46890-46898.
6. Wang, X., et al., The association between the LRRK2 R1628P variant and the risk of Parkinson's disease in Asian: a meta-analysis. Neurosci Lett, 2016. 623: p. 22-7.
7. Lu, C.S., et al., The LRRK2 Arg1628Pro variant is a risk factor for Parkinson's disease in the Chinese population. Neurogenetics, 2008. 9(4): p. 271-6.
8. Zhang, Z., et al., LRRK2 R1628P variant is a risk factor of Parkinson's disease among Han-Chinese from mainland China. Mov Disord, 2009. 24(13): p. 1902-5.
9. Ross, O.A., et al., Analysis of Lrrk2 R1628P as a risk factor for Parkinson's disease. Ann Neurol, 2008. 64(1): p. 88-92.