Thanh bên bài viết

pdf
Ngày xuất bản: 02/04/2025
Số lượt xem tóm tắt: 46
Số lượt xem pdf: 35
DOI: https://doi.org/10.51298/vmj.v547i3.13138
Số xuất bản
Tập 547 Số 3 (2025)
Chuyên mục
Các bài báo
Trích dẫn bài báo
Mai Thanh, B., Nghiêm Xuân, H., Đào Phương, G., & Nguyễn Nhật, H. (2025). LỰA CHỌN NHÓM MICRORNA TIỀM NĂNG TRONG CHẨN ĐOÁN UNG THƯ DẠ DÀY TỪ NHỮNG CƠ SỞ DỮ LIỆU HIỆN CÓ. Tạp Chí Y học Việt Nam, 547(3). https://doi.org/10.51298/vmj.v547i3.13138

LỰA CHỌN NHÓM MICRORNA TIỀM NĂNG TRONG CHẨN ĐOÁN UNG THƯ DẠ DÀY TỪ NHỮNG CƠ SỞ DỮ LIỆU HIỆN CÓ

Mai Thanh Bình1,, Nghiêm Xuân Hoàn1, Đào Phương Giang1, Nguyễn Nhật Hạ2
1 Bệnh viện Trung ương Quân đội 108
2 Trường Đại học Y Hà Nội

Nội dung chính của bài viết

Tóm tắt

Tổng quan: Ung thư dạ dày (UTDD) là ung thư đứng thứ 4 trong các mặt bệnh ung thư về tỷ lệ mắc mới và đứng thứ 3 vể tỷ lệ tử vong liên quan ung thư thường gặp tại Việt Nam. MicroRNA (miRNA) tham gia vào nhiều quá trình tế bào bao gồm tăng sinh, biệt hóa, apoptosis và đóng vai trò quan trọng trong sinh bệnh học của UTDD. MiRNA có tính ổn định cao trong máu và do đó chẩn đoán UTDD không xâm lấn bằng cách sử dụng miRNA lưu hành trong máu là một biện pháp đầy hứa hẹn. Phương pháp: Danh pháp miRNA, chú thích trình tự và thông tin mục tiêu có sẵn được lấy từ các nền tảng cơ sở dữ liệu sẵn có như miRBase, mirTarbase, miRCancer và KEGG. Sử dụng các công cụ tin sinh TargetScan và miRDB, phân tích các cơ sở dữ liệu miRNA đã thu thập để phân nhóm, dự báo các miRNA có liên quan chặt chẽ tới UTDD. Kết quả: Tổng số 449 miRNA được trích xuất từ miRBase, mirTarbase và miRCancer, và 302 miRNA được thu thập từ cơ sở dữ liệu KEGG liên quan tới UTDD. Sau phân tích 2 tệp dữ liệu, 8 microRNA (bao gồm hsa-miR-144-3p, hsa-miR-424-5p, hsa-miR-34a-5p, hsa-let-7f-5p, hsa-7a-5p, hsa-miR-421, hsa-miR-196b-5p và hsa-miR-193a-3p) vượt qua phân tích lựa chọn của Targetscan, và có điểm CWCS> -0,4 trên công cụ tin sinh miRDB cho thấy liên quan chặt chẽ tới UTDD. Kết luận: Sau phân tích bằng Targetscan và miRBase, tìm được một số microRNA tiềm năng có thể sử dụng để thiết kế nghiên cứu, đánh giá giá trị của microRNA trong hỗ trợ chẩn đoán UTDD.

Chi tiết bài viết

Từ khóa

microRNA tiềm năng, ung thư dạ dày, database

Tài liệu tham khảo

1. Moore, A.C., J.S. Winkjer, T.T. Tseng, Bioinformatics Resources for MicroRNA Discovery. Biomark Insights, 2015. 10(Suppl 4): p. 53-8.
2. Chou, N.H., et al., MiR-193a-5p and -3p Play a Distinct Role in Gastric Cancer: miR-193a-3p Suppresses Gastric Cancer Cell Growth by Targeting ETS1 and CCND1. Anticancer Res, 2018. 38(6): p. 3309-3318.
3. Gorur, A., et al., Determination of plasma microRNA for early detection of gastric cancer. Mol Biol Rep, 2013. 40(3): p. 2091-6.
4. Jiang, Z., et al., Increased expression of miR-421 in human gastric carcinoma and its clinical association. J Gastroenterol, 2010. 45(1): p. 17-23.
5. Li, B., et al., MicroRNA-144-3p suppresses gastric cancer progression by inhibiting epithelial-to-mesenchymal transition through targeting PBX3. Biochem Biophys Res Commun, 2017. 484(2): p. 241-247.
6. Liu, W.J., et al., Expression of serum let-7c, let-7i, and let-7f microRNA with its target gene, pepsinogen C, in gastric cancer and precancerous disease. Tumour Biol, 2015. 36(5): p. 3337-43.
7. Ogata, H., et al., KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. Nucleic Acids Res, 1999. 27(1): p. 29-34.
8. Wei, B., et al., MicroRNA‑34a attenuates the proliferation, invasion and metastasis of gastric cancer cells via downregulation of MET. Mol Med Rep, 2015. 12(4): p. 5255-61.