ỨNG DỤNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ THẾ HỆ MỚI (NGS) TÌM ĐỘT BIẾN GENE TRÊN BỆNH NHI MẮC HỘI CHỨNG THẬN HƯ: BÁO CÁO CA BỆNH
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Mục tiêu: Xây dựng quy trình giải trình tự gene thế hệ mới (Illumina) toàn bộ exon (WES) tầm soát đột biến gene trên bệnh nhi được chẩn đoán mắc hội chứng thận hư và xác nhận lại bằng phương pháp giải trình tự Sanger. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Mẫu máu 4 bệnh nhi, được bác sĩ chẩn đoán HCCT thông qua biểu hiện lâm sàng, xét nghiệm máu và nước tiểu, được gửi tới chúng tôi để giải trình tự gen.Tiến hành tách chiết DNA bộ gen trong mẫu máu sử dụng kit Qiagen (Hoa Kỳ), lai-bắt giữ các phân đoạn DNA của các gen mục tiêu và xây dựng thư viện trình tự bằng bộ kit New England Biolabs (Hoa Kỳ), giải trình tự bằng hệ thống giải trình tự thế hệ mới Illumina (Hoa Kỳ) và xác định lại bằng kỹ thuật giải trình tự Sanger. Kết quả: Chúng tôi phát hiện được đồng hợp biến thể NM_014625.2:c.799G>T (p.Asp267Tyr) trên gen NPHS2 của 2 chị em bệnh nhi, dự đoán bằng phần mềm Polyphen và SIFT phù hợp với chẩn đoán ban đầu của bác sĩ là mắc HCTH kháng corticoid. Phát hiện biến thể c.2858 G>T (Gly953Val) dị hợp trên gen COL4A5 và biến thể c.3255 G>A (Met1085Ile) dị hợp trên gen COL4A3 của một bệnh nhi, chẩn đoán ban đầu là xơ hóa cầu thận khu trú từng vùng (FSGS). Phát hiện biến thể c.2630 G>A dị hợp trên gen COL4A4 của bệnh nhân đang được bác sĩ điều trị và theo dõi HCTH bẩm sinh. Kết luận: Qui trình giải trình tự toàn bộ exon bằng kỹ thuật giải trình tự gen thế hệ mới (NGS) tìm đột biến gene mục tiêu từ mẫu máu bệnh nhân HCTH đã được thiết lập thành công tại labo của chúng tôi. Kết quả giải trình tự được phân tích bằng các công cụ insilico như phần mềm Polyphen và SIFT dự đoán chức năng của đột biến gene. Hội chứng Alport có thể bị bỏ sót chẩn đoán.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
hội chứng thận hư, gene COL4A5, COL4A4, COL4A3, hội chứng Alport, gen NPHS2
Tài liệu tham khảo

2. Ehrich JH, Geerlings C, Zivicnjak M, et al. Steroid-resistant idiopathic childhood nephrosis: overdiagnosed and undertreated. Nephrol Dial Transplant 2007; 22:2183.

3. Hinkes BG, Mucha B, Vlangos CN, Gbadegesin R, Liu J, Hasselbacher K, Hangan D, Ozaltin F, Zenker M, Hildebrandt F, Arbeitsgemeinschaft fur Paediatrische Nephrologie Study Group. Nephrotic syndrome in the first year of life: two thirds of cases are caused by mutations in 4 genes (NPHS1, NPHS2, WT1, and LAMB2). Pediatrics. 2007 Apr 1;119(4):e907-19.

4. Lipska-Ziętkiewicz BS, Ozaltin F, Hölttä T, et al. Genetic aspects of congenital nephrotic syndrome: a consensus statement from the ERKNet-ESPN inherited glomerulopathy working group. Eur J Hum Genet 2020; 28:1368.

5. Lovric S, Ashraf S, Tan W, Hildebrandt F. Genetic testing in steroid-resistant nephrotic syndrome: when and how? Nephrol Dial Transplant 2016; 31:1802.

6. Trautmann A, Boyer O, Hodson E, et al. IPNA clinical practice recommendations for the diagnosis and management of children with steroid-sensitive nephrotic syndrome. Pediatr Nephrol 2023; 38:877.

7. Sadowski CE, Lovric S, Ashraf S, et al. A single-gene cause in 29.5% of cases of steroid-resistant nephrotic syndrome. J Am Soc Nephrol 2015; 26:1279.
