Thanh bên bài viết
Số lượt xem pdf: 62
XÂY DỰNG VÀ TỐI ƯU HÓA QUY TRÌNH PCR ĐA MỒI PHÁT HIỆN ĐỒNG THỜI CÁC GEN BLAOXA TRÊN ACINETOBACTER BAUMANNII KHÁNG CARBAPENEM
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Acinetobacter baumannii là tác nhân gây nhiễm khuẩn bệnh viện quan trọng, nổi bật bởi khả năng kháng nhiều loại kháng sinh, đặc biệt là carbapenem, chủ yếu thông qua cơ chế sản xuất β-lactamase nhóm OXA. Trước tình trạng gia tăng các chủng đa kháng thuốc, nhu cầu về các phương pháp chẩn đoán nhanh, chính xác và chi phí hợp lý trở nên cấp thiết. Nghiên cứu này xây dựng và tối ưu hóa quy trình PCR đa mồi (multiplex PCR) nhằm phát hiện đồng thời bốn gen mục tiêu: 16S-rRNA, blaOXA-23, blaOXA-51 và blaOXA-58, phục vụ định danh và đánh giá khả năng kháng thuốc của A. baumannii. Các điều kiện phản ứng được khảo sát hệ thống, bao gồm nhiệt độ lai, nồng độ mồi, nồng độ dNTP, lượng Taq DNA polymerase, giới hạn phát hiện và độ đặc hiệu của từng cặp mồi. Quy trình tối ưu sử dụng nhiệt độ lai 58°C, nồng độ mồi 0,15 µM, dNTP 0,25 mM và Taq DNA polymerase 1,25U, đạt giới hạn phát hiện 10 CFU/ml mà không ghi nhận dương tính giả. Kết quả giải trình tự và phân tích BLAST khẳng định độ đặc hiệu tuyệt đối của các cặp mồi. Quy trình multiplex PCR này có tiềm năng ứng dụng cao trong vi sinh lâm sàng, hỗ trợ phát hiện sớm và chính xác các chủng A. baumannii kháng carbapenem, từ đó góp phần nâng cao hiệu quả kiểm soát nhiễm khuẩn và tối ưu hóa điều trị kháng sinh
Chi tiết bài viết
Từ khóa
Multiplex PCR, blaOXA-23, blaOXA-51, blaOXA-58, 16S-rRNA, Acinetobacter baumannii
Tài liệu tham khảo
2. Mugnier PD, Poirel L, Naas T, et al., (2010), “Worldwide dissemination of the blaOXA-23 Carbapenemase gene of Acinetobacter baumannii1.” Emerging infectious diseases, 16(1), 35.
3. Woodford N, Ellington MJ, Coelho JM, et al., (2006), “Multiplex PCR for genes encoding prevalent OXA carbapenemases in Acinetobacter spp.” International journal of antimicrobial agents, 27(4), 351-3.
4. Versalovic J, (2011), Manual of clinical microbiology, American Society for Microbiology Press, pp.
5. Mackay IM, (2007), Real-time PCR in microbiology, Caister Academic Press Norfolk, UK, pp.
6. Roux KH, (2009), “Optimization and troubleshooting in PCR.” Cold Spring Harbor Protocols, 2009(4), pdb. ip66.
7. Basu C, (2015), PCR primer design, Springer, pp.
8. Adeyemi OO, Herod MR, Oladiji F, et al., (2017), “A multi‐template multiplex PCR assay for hepatitis B virus and human β‐globin.” Journal of Medical Virology, 89(11), 1944-51.