PHÁT TRIỂN PHƯƠNG PHÁP MỚI ĐỊNH DANH NHANH CHỦNG NẤM ASPERGILLUS FLAVUS BẰNG QUANG PHỔ RAMAN
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Đặt vấn đề: Vi nấm được xác định là một tác nhân trực tiếp, nguy hiểm có thể gây hại cho thi thể ướp bảo quản lâu năm phục vụ chiêm ngưỡng. Khi ô nhiễm từ ngoài vào mô thi thể ướp bảo quản, vi nấm có thể thông qua cơ chế xâm nhiễm và sinh enzyme để phát triển gây phá hủy các cấu trúc mô da, mô tóc...của thi thể ướp. Việc phát triển các phương pháp định danh vi nấm mới, nhanh, đáng tin cậy là rất cần thiết và có ý nghĩa.
Mục tiêu nghiên cứu: Ứng dụng quang phổ Raman để định danh nhanh chủng nấm A. flavus..
Phương pháp nghiên cứu: Chủng vi nấm A.flavus (QG17-007) được phục hồi và định danh hình thái (soi kính hiển vi quang học và điện tử truyền qua SEM). Sau đó sử dụng phương pháp quang phổ Raman ở điều kiện tối ưu (nguồn lazer, đế soi mẫu, nồng độ bào tử trần) tiến hành thu phổ Raman đặc trưng cho bào tử trần vi nấm và đối chiếu với thư viện dữ liệu chuẩn để xác định loài vi nấm.
Kết quả: Trong nghiên cứu này quang phổ Raman được thu nhận từ chủng nấm A. flavus với các đỉnh đặc trưng tại các vị trí 414, 421, 1001, 1193, 1350, 1445, 1463, 1648, 1673, 1745 cm-1. Đây là những đỉnh đặc trưng cho các liên kết tương ứng với các cấu trúc sinh học chính trong bào tử trần vi nấm bao gồm liên kết β (1,3) D-glucan/chitin của thành tế bào, phenylalanine (protein), amide I, amide III, lipid đặc trưng cho loài A.flavus.
Kết luận: Nghiên cứu mở ra tiềm năng ứng dụng quang phổ Raman như một phương pháp chẩn đoán nhanh các loài vi nấm, các thành phần của các loài vi nấm hiện đang được bảo quản tại Viện 69.
Từ khóa
Quang phổ Raman, Aspergillus flavus, bào tử trần
Chi tiết bài viết
Tài liệu tham khảo
2. Strycker, B.D., et al., Identification of toxic mold species through Raman spectroscopy of fungal conidia. PloS one, 2020. 15(11): p. e0242361.
3. Rostron, P., S. Gaber, and D. Gaber, Raman spectroscopy, review. laser, 2016. 21: p. 24.
4. Han, Z., et al., Molecular origin of the Raman signal from Aspergillus nidulans conidia and observation of fluorescence vibrational structure at room temperature. Scientific reports, 2020. 10(1): p. 5428.
5. Schlücker, S., et al., Raman microspectroscopy: a comparison of point, line, and wide-field imaging methodologies. Analytical Chemistry, 2003. 75(16): p. 4312-4318.
6. Ghosal, S., J.M. Macher, and K. Ahmed, Raman microspectroscopy-based identification of individual fungal spores as potential indicators of indoor contamination and moisture-related building damage. Environmental science & technology, 2012. 46(11): p. 6088-6095.
7. Wasim, M., et al., Surface-enhanced Raman spectroscopy for monitoring the biochemical changes due to DNA mutations induced by CRISPR-Cas9 genome editing in the Aspergillus niger fungus. ACS omega, 2024. 9(13): p. 15202-15209.
8. Saif, F., et al., Identification and characterization of Aspergillus species of fruit rot fungi using microscopy, FT-IR, Raman and UV–Vis spectroscopy. Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 2021. 246: p. 119010.