Thanh bên bài viết
Số lượt xem PDF: 236
SO SÁNH QUY TRÌNH LAMP VỚI QUY TRÌNH NUÔI CẤY PHÂN LẬP PHÁT HIỆN GEN ĐỘC TỐ TYPE A, B CỦA VI KHUẨN CLOSTRIDIUM BOTULINUM TRÊN MẪU THỰC PHẨM VÀ BỆNH PHẨM LÂM SÀNG
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Mục tiêu: Nghiên cứu tiến hành so sánh quy trình LAMP với quy trình nuôi cấy phát hiện gen độc tố của vi khuẩn Clostridium botulinum (C. botulinum) type A, B. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Nghiên cứu thực nghiệm trong phòng thí nghiệm trên 90 mẫu thực phẩm và bệnh phẩm lâm sàng. Kết quả: Sử dụng kết quả của quy trình nuôi cấy phân lập phát hiện gen độc tố làm tiêu chuẩn để so sánh với quy trình LAMP. Kết quả nghiên cứu cho thấy số mẫu cho kết quả dương tính khi thực hiện quy trình LAMP phát hiện gen độc tố type A, B của vi khuẩn C. botulinum là 12/90 (13,3%) trong khi đó quy trình nuôi cấy phân lập phát hiện gen độc tố là 11/90 (12,2%). Độ nhạy, độ đặc hiệu và độ đúng (độ chính xác) của quy trình LAMP phát hiện gen độc tố type A, B của vi khuẩn C. botulinum lần lượt là 91,6%, 100%, và 98,8%. Bên cạnh đó, tỷ lệ dương tính giả 8,33%, tỷ lệ âm tính giả 0%, đặc biệt hệ số kappa là 0,986 cho thấy mức độ đồng thuận gần như hoàn toàn giữa 2 quy trình. Ngoài ra, quy trình LAMP cho thấy nhiều ưu điểm như thời gian thực hiện nhanh hơn, tiết kiệm chi phí hơn, dễ thực hiện hơn, có thể triển khai ở tất cả các phòng xét nghiệm từ nhỏ đến lớn để phát hiện độc tố của vi khuẩn C. botulinum type A, B trong thực phẩm cũng như các mẫu bệnh phẩm lâm sàng.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
Độc tố botulinum, Clostridium botulinum, LAMP, Ngộ độc thịt
Tài liệu tham khảo
2. Tăng Thị Nga, Vũ Thị Mai Hiền, Đặng Đức Anh, Phạm Bảo Yên, Nguyên Thị Hương Giang, Đoàn Thu Trà, Nguyễn Trung Nguyên, Vũ Duy Nhàn, và Nguyên Thùy Trâm (2021), Phát hiện Clostridium botulinum trong mật ong, đất và thực phẩm đóng hộp tự chế biến ở một số tỉnh miền Bắc Việt Nam năm 2019-2020, Tạp chí Y học Dự phòng, số 31(2), tr. 35-41.
3. Petr Čapek và Tobin J Dickerson (2010), Sensing the deadliest toxin: technologies for botulinum neurotoxin detection, Toxins, số 2(1), tr. 24-53.
4. Andreja Rajkovic, Benaissa El Moualij, Youssef Fikri, Katelijne Dierick, Willy Zorzi, Ernst Heinen, Ahu Uner, và Mieke Uyttendaele (2012), Detection of Clostridium botulinum neurotoxins A and B in milk by ELISA and immuno-PCR at higher sensitivity than mouse bio-assay, Food Analytical Methods, số 5(3), tr. 319-326.
5. Susana M Vieira, Uzay Kaymak, và João MC Sousa. Cohen's kappa coefficient as a performance measure for feature selection. in International Conference on Fuzzy Systems. 2010. IEEE.
6. Miia Lindström, Riikka Keto, Annukka Markkula, Mari Nevas, Sebastian Hielm, và Hannu Korkeala (2001), Multiplex PCR assay for detection and identification of Clostridium botulinum types A, B, E, and F in food and fecal material, Applied and environmental microbiology, số 67(12), tr. 5694-5699.
7. Tsugunori Notomi, Hiroto Okayama, Harumi Masubuchi, Toshihiro Yonekawa, Keiko Watanabe, Nobuyuki Amino, và Tetsu Hase (2000), Loop-mediated isothermal amplification of DNA, Nucleic acids research, số 28(12), tr. e63-e63.
8. T Sakuma, Y Kurosaki, Y Fujinami, T Takizawa, và J Yasuda (2009), Rapid and simple detection of Clostridium botulinum types A and B by loop‐mediated isothermal amplification, Journal of applied microbiology, số 106(4), tr. 1252-1259.