XÁC NHẬN GIÁ TRỊ SỬ DỤNG PHƯƠNG PHÁP GỘP QUE TRONG KỸ THUẬT REAL-TIME RT PCR CHẨN ĐOÁN SARS-COV-2

Nguyễn Thị Băng Sương 1,2,, Lưu Nguyễn Trung Thông 1, Mai Thị Bích Chi 1, Nguyễn Hữu Huy1, Nguyễn Hoàng Bắc 1,2
1 Bệnh viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh
2 Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh

Nội dung chính của bài viết

Tóm tắt

Mở đầu: Phương pháp gộp que trong xét nghiệm real-time RT-PCR chẩn đoán SARS-CoV-2 được sử dụng phổ biến vì giúp tiết kiệm thời gan, nguồn lực, sàng lọc nhanh chóng trong khi vẫn bảo đảm độ tin cậy. Các phòng xét nghiệm cần thực hiện thẩm định xác nhận giá trị sử dụng hình thức gộp mẫu trước khi đưa vào sử dụng. Mục tiêu: So sánh khả năng phát hiện SARS-CoV-2 của kỹ thuật real-time RT PCR trên mẫu gộp que so với mẫu đơn. Đối tượng và phương pháp: Nghiên cứu mô tả và thực nghiệm labo. Mẫu gộp 2, gộp 5 và gộp 10 được tạo từ các mẫu bệnh phẩm dịch tỵ hầu đã được xác định âm tính và dương tính với SARS-CoV-2 bằng real-time RT PCR trên 2 bộ sinh phẩm Allplex™ SARS-CoV-2 Assay (Seegene) và Alinity m SARS-CoV-2 assay (Abbott). Kết quả: Độ tương đồng chẩn đoán dương SARS-CoV-2 ở mẫu gộp 2, gộp 5 và gộp 10 là 100% khi so với mẫu đơn với độ chênh lệch Ct trung bình của các gen không vượt quá 1,7. Kết luận: Nghiên cứu cho thấy khả năng phát hiện mẫu dương tính với SARS-CoV-2 bằng kỹ thuật real-time RT PCR ở mẫu gộp que là tương đương với mẫu đơn.

Chi tiết bài viết

Tài liệu tham khảo

1. Christoff, A.P., et al., Swab pooling: A new method for large-scale RT-qPCR screening of SARS-CoV-2 avoiding sample dilution. PLoS One, 2021. 16(2): p. e0246544.
2. Torres, I., E. Albert, and D. Navarro, Pooling of nasopharyngeal swab specimens for SARS‐CoV‐2 detection by RT‐PCR. Journal of Medical Virology, 2020.
3. Administration, U.S.F.D., Amending Certain EUAs for RT-PCR Molecular-Based Diagnostic Tests to Authorize the Detection of Nucleic Acid from SARS- CoV-2 from Pooled Anterior Nasal Respiratory Specimens for Screening When Used as Part of a Serial Testing Program 2021.
4. Food and D. Administration, United States of America. Pooled sample testing and screening testing for COVID-19. 2020.
5. Vân, P.N.T., et al., XÁC ĐỊNH GIÁ TRỊ SỬ DỤNG CỦA PHƯƠNG PHÁP GỘP DUNG DỊCH TRONG CHẨN ĐOÁN SARS-COV-2 BẰNG KỸ THUẬT RT-qPCR. Tạp chí Y học Việt Nam, 2022. 515(2).
6. Wunsch, M., et al., Safe and effective pool testing for SARS-CoV-2 detection. Journal of Clinical Virology, 2021. 145: p. 105018.