SO SÁNH GIÁ TRỊ SỬ DỤNG PHƯƠNG PHÁP GỘP QUE VÀ GỘP DUNG DỊCH TRONG KỸ THUẬT REAL-TIME RT PCR CHẨN ĐOÁN SARS-COV-2

Nguyễn Thị Băng Sương 1,2,, Lưu Nguyễn Trung Thông1, Mai Thị Bích Chi 1, Nguyễn Hữu Huy1, Hoàng Ngọc Bảo Mi1, Nguyễn Hoàng Bắc1,2
1 Bệnh viện Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh
2 Đại học Y Dược TP.Hồ Chí Minh

Nội dung chính của bài viết

Tóm tắt

Mở đầu: Phương pháp gộp que và gộp dung dịch trong xét nghiệm real-time RT-PCR chẩn đoán SARS-CoV-2 được sử dụng phổ biến vì giúp tiết kiệm thời gian, nguồn lực, sàng lọc nhanh chóng trong khi vẫn bảo đảm độ tin cậy. Các phòng xét nghiệm cần thực hiện thẩm định xác nhận giá trị sử dụng các hình thức gộp mẫu trước khi đưa vào sử dụng. Mục tiêu: So sánh khả năng phát hiện SARS-CoV-2 của kỹ thuật real-time RT PCR trên mẫu gộp que và gộp dung dịch. Đối tượng và phương pháp: Nghiên cứu mô tả và thực nghiệm labo. Mẫu gộp 2, gộp 5 và gộp 10 được lấy từ các mẫu bệnh phẩm dịch tỵ hầu đã được xác định âm tính và dương tính với SARS-CoV-2 bằng real-time RT PCR trên 2 bộ sinh phẩm Allplex™ SARS-CoV-2 Assay (Seegene) và Alinity m SARS-CoV-2 Assay (Abbott). Kết quả: Độ tương đồng chẩn đoán SARS-CoV-2 giữa mẫu đơn và mẫu gộp que (gộp 2, gộp 5 và gộp 10) là 100% đối với hình thức gộp que. Với hình thức gộp dung dịch, độ tương đồng là 100% với các mẫu có khoảng Ct từ 15 – 30, trong khi đó ở khoảng Ct từ 31 – 37 độ tương đồng chẩn đoán là 90%. Kết luận: Qua nghiên cứu cho thấy phương pháp gộp que có độ tương đồng chẩn đoán và độ chênh lệch Ct trung bình giữa mẫu đơn và mẫu gộp ở hình thức gộp que là tốt hơn so với gộp dung dịch

Chi tiết bài viết

Tài liệu tham khảo

1. Christoff, A.P., et al., Swab pooling: A new method for large-scale RT-qPCR screening of SARS-CoV-2 avoiding sample dilution. PLoS One, 2021. 16(2): p. e0246544.
2. Torres, I., E. Albert, and D. Navarro, Pooling of nasopharyngeal swab specimens for SARS‐CoV‐2 detection by RT‐PCR. Journal of Medical Virology, 2020.
3. Administration, U.S.F.D., Amending Certain EUAs for RT-PCR Molecular-Based Diagnostic Tests to Authorize the Detection of Nucleic Acid from SARS- CoV-2 from Pooled Anterior Nasal Respiratory Specimens for Screening When Used as Part of a Serial Testing Program 2021.
4. Food and D. Administration, United States of America. Pooled sample testing and screening testing for COVID-19. 2020.
5. Vân, P.N.T., et al., XÁC ĐỊNH GIÁ TRỊ SỬ DỤNG CỦA PHƯƠNG PHÁP GỘP DUNG DỊCH TRONG CHẨN ĐOÁN SARS-COV-2 BẰNG KỸ THUẬT RT-qPCR. Tạp chí Y học Việt Nam, 2022. 515(2).
6. Praharaj, Ira, et al. "Pooled testing for COVID-19 diagnosis by real-time RT-PCR: A multi-site comparative evaluation of 5-& 10-sample pooling." The Indian Journal of Medical Research 152.1-2 (2020): 88.
7. Wunsch, M., et al., Safe and effective pool testing for SARS-CoV-2 detection. Journal of Clinical Virology, 2021. 145: p. 105018.