Thanh bên bài viết
Số lượt xem PDF: 92
PHÂN TÍCH ẢNH HƯỞNG CỦA MỘT SỐ ĐIỀU KIỆN KHÁC NHAU LÊN SỰ BIỂU HIỆN MRNA CỦA GEN MEST VÀ MỘT SỐ GEN LIÊN QUAN ĐẾN TĂNG SINH MỠ TRÊN CHUỘT THÔNG QUA DỮ LIỆU MICROARRAY
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Mục tiêu: Phân tích sự thay đổi mức độ biểu hiện mRNA trên mô mỡ của gen Mest và một số gen liên quan đến quá trình tăng sinh mỡ ở chuột tại một số điều kiện khác nhau thông qua phân tích dữ liệu microarray. Phương pháp: Sử dụng ngôn ngữ R phân tích dữ liệu microarray từ bộ dữ liệu GSE62350 trên chuột ở 10 ngày tuổi và 21 ngày tuổi được nuôi ở 2 mức nhiệt độ môi trường là 17℃ và 29℃ để tìm ra các gen có sự thay đổi mức độ biểu hiện mRNA (DEG). Kết quả: Xác định được 839 DEG (trong đó có gen Mest) khi chuột thay đổi độ tuổi, 11 DEG khi thay đổi nhiệt độ môi trường. Từ đó phát hiện 41 DEG có liên quan đến quá trình mô mỡ tăng sinh. Mức độ biểu hiện mRNA của gen Mest giảm mạnh khoảng 40-60 lần ở chuột 21 ngày tuổi so với 10 ngày tuổi, trong khi đó 36/41 DEG liên quan đến tăng sinh mỡ lại tăng mức độ biểu hiện. Đặc điểm biểu hiện mRNA ở gen Mest có sự tương đồng với cụm 13 DEG, phần lớn các DEG này có liên quan với con đường chuyển hóa chất. Kết luận: Mức độ biểu hiện mRNA của gen Mest và các gen liên quan đến tăng sinh và mở rộng mô mỡ thay đổi đáng kể khi chuột thay đổi độ tuổi, tuy nhiên, không tìm được sự khác biệt có ý nghĩa thống kê khi chuột được nuôi ở 2 mức nhiệt độ là 17℃ và 29℃.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
Mest, tăng sinh mỡ, mức độ biểu hiện mRNA.
Tài liệu tham khảo
2. Kadota, Y., et al., Mouse mesoderm-specific transcript inhibits adipogenic differentiation and induces trans-differentiation into hepatocyte-like cells in 3T3-L1 preadiocytes. BMC Research Notes, 2022. 15(1): p. 164.
3. Yang, Y., S.J. Adelstein, and A.I. Kassis, Target discovery from data mining approaches. Drug Discovery Today, 2012. 17: p. S16-S23.
4. Rosell, M., et al., Brown and white adipose tissues: intrinsic differences in gene expression and response to cold exposure in mice. American Journal of Physiology-Endocrinology and Metabolism, 2014. 306(8): p. E945-E964.
5. Chu, D.-T., et al., C57BL/6J mice as a polygenic developmental model of diet-induced obesity. Physiological Reports, 2017. 5(7): p. e13093.
6. Chabowska-Kita, A., et al., Low ambient temperature during early postnatal development fails to cause a permanent induction of brown adipocytes. The FASEB Journal, 2015. 29(8): p. 3238-3252.
7. Chen, J.J., et al., Selection of differentially expressed genes in microarray data analysis. The Pharmacogenomics Journal, 2007. 7(3): p. 212-220.
8. Mayer, W., et al., Expression of the imprinted genes MEST/Mest in human and murine placenta suggests a role in angiogenesis. Developmental Dynamics, 2000. 217(1): p. 1-10.
9. Moreno-Mendez, E., et al., Early-life programming of adipose tissue. Nutrition Research Reviews, 2020. 33(2): p. 244-259.
10. Choi, M.-S., et al., High-fat diet decreases energy expenditure and expression of genes controlling lipid metabolism, mitochondrial function and skeletal system development in the adipose tissue, along with increased expression of extracellular matrix remodelling- and inflammation-related genes. British Journal of Nutrition, 2015. 113(6): p. 867-877.