Thanh bên bài viết
Số lượt xem pdf: 33
BIẾN THỂ C.2678 G>C (GLY893ALA) TRONG GEN COL4A5 TRÊN BỆNH NHÂN NGHI NGỜ MẮC HỘI CHỨNG ALPORT
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Mục tiêu: Xây dựng quy trình giải trình tự gene thế hệ mới (Illumina) tầm soát đột biến gene COL4A5, COL4A3, COL4A4 trên bệnh nhi viêm cầu thận nghi ngờ Alport và xác nhận lại bằng phương pháp giải trình tự Sanger. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Mẫu máu bệnh nhi 7 tuổi được chẩn đoán viêm cầu thận và mẫu máu của cha, mẹ, anh. Tiến hành tách chiết DNA bộ gen trong mẫu máu sử dụng kit Qiagen (Hoa Kỳ), lai-bắt giữ các phân đoạn DNA của các gen mục tiêu và xây dựng thư viện trình tự bằng bộ kit New England Biolabs (Hoa Kỳ), giải trình tự bằng hệ thống giải trình tự thế hệ mới Illumina (Hoa Kỳ) và xác định lại bằng kỹ thuật giải trình tự Sanger. Kết quả: Tìm thấy đột biến c.2678 G>C (Gly893Ala) gen COL4A5, được dự đoán là nguyên nhân gây hội chứng Alport X-linked từ các công cụ insilico dự đoán chức năng của đột biến gene, cho thấy phù hợp với lâm sàng của bệnh nhi. Kết luận: Qui trình giải trình tự NGS tìm đột biến gene mục tiêu từ mẫu máu bệnh nhân viêm cầu thận đã được thiết lập thành công tại labo của chúng tôi. Đột biến phát hiện được trên gene Col4a5 là đột biến mới của bệnh nhân, di truyền từ mẹ.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
gene Col4A5, hội chứng Alport, biến thể c.2678 G>C (Gly893Ala)
Tài liệu tham khảo
2. Boisson, M., et al. (2023). "A wave of deep intronic mutations in X-linked Alport syndrome." Kidney International 104(2): 367-377.
3. Horinouchi, T., et al. (2019). "Determination of the pathogenicity of known COL4A5 intronic variants by in vitro splicing assay." Scientific reports 9(1): 12696.
4. Horinouchi, T., et al. (2018). "Detection of splicing abnormalities and genotype-phenotype correlation in X-linked Alport syndrome." Journal of the American Society of Nephrology 29(8): 2244-2254.
5. Horinouchi, T., et al. (2020). "Pathogenic evaluation of synonymous COL4A5 variants in X‐linked Alport syndrome using a minigene assay." Molecular Genetics & Genomic Medicine 8(8): e1342.
6. Okada, E., et al. (2023). "Aberrant splicing caused by exonic single nucleotide variants positioned 2nd or 3rd to the last nucleotide in the COL4A5 gene." Clinical and Experimental Nephrology 27(3): 218-226.
7. Zhang, R., et al. (2024). "Three exonic variants in the COL4A5 gene alter RNA splicing in a minigene assay." Molecular Genetics & Genomic Medicine 12(2): e2395.