ĐẶC ĐIỂM PHÂN TỬ CỦA VI KHUẨN ESCHERICHIA COLI MANG GEN MCR-1 PHÂN LẬP TRÊN NGƯỜI KHỎE MẠNH TẠI THÁI BÌNH
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Nghiên cứu được thực hiện nhằm phân tích một số đặc điểm phân tử của các chủng vi khuẩn Escherichia coli mang gen mcr-1 đã phân lập được từ mẫu phân của người khỏe mạnh tại Thái Bình trong giai đoạn 2013 - 2016. Đối tượng nghiên cứu bao gồm 31 chủng vi khuẩn Escherichia coli đã được xác định là mang gen mcr-1 và có kiểu hình kháng colistin (nồng độ ức chế tối thiểu với colistin MIC ≥ 4 mg/L). Kiểu gen mã hóa ESBL, gen kháng colistin mcr-1, sự có mặt của transposon ISApl1 và các plasmid của các chủng E. coli mang gen mcr-1 đều được xác định bằng kỹ thuật PCR. Liên quan di truyền giữa các chủng E. coli mang gen mcr-1 được phân tích bằng kỹ thuật điện di xung trường (PFGE). Kết quả cho thấy hầu hết (96,8%) các chủng E. coli mang gen mcr-1 cũng đồng thời mang gen mã hóa ESBL, trong đó hai kiểu gen chiếm tỷ lệ cao nhất là CTX-M-9 (48,4%) và CTX-M-9/TEM (25,8%). Mỗi chủng E. coli mang gen mcr-1 có thể có từ 1 - 6 loại plasmid khác nhau trong số 14 loại plasmid được phát hiện ở các chủng này. Ba loại plasmid thường gặp nhất là plasmid HI2 (54,8%), FIB (48,4%) và N (41,9%). Trình tự ISApl1 được phát hiện ở 83,9% số chủng E. coli mang gen mcr-1. Kết quả phân tích PFGE cho thấy có 4 chủng tạo thành hai nhóm di truyền mà các chủng trong cùng nhóm có tỷ lệ tương đồng di truyền là 100%. Nghiên cứu cho thấy có sự lây lan của vi khuẩn E. coli mang gen mcr-1 đồng thời mang gen sinh ESBL trong quần thể người khỏe mạnh tại Thái Bình. Sự đa dạng của các loại plasmid và tỷ lệ cao mang trình tự ISApl1 ở vi khuẩn E. coli có thể là các yếu tố thuận lợi cho sự lan truyền gen mcr-1 ở vi khuẩn E. coli trên người khỏe mạnh tại Thái Bình.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
E. coli, ESBL, kháng colistin, mcr-1.
Tài liệu tham khảo
2. Carattoli, A., Bertini, A., Villa, L., et al. (2005). Identification of plasmids by PCR-based replicon typing. Journal of microbiological methods, 63(3), 219–228.
3. Fernandes, M. R., McCulloch, J. A., Vianello, M. A., Moura, Q., Pérez-Chaparro, P. J., Esposito, F., Sartori, L., Dropa, M., et al. (2016). First Report of the Globally Disseminated IncX4 Plasmid Carrying the mcr-1 Gene in a Colistin-Resistant Escherichia coli Sequence Type 101 Isolate from a Human Infection in Brazil. Antimicrobial agents and chemotherapy, 60(10), 6415–6417.
4. Kawahara, R., Fujiya, Y., Yamaguchi, T., et al. (2019). Most Domestic Livestock Possess Colistin-Resistant Commensal Escherichia coli Harboring mcr in a Rural Community in Vietnam. Antimicrobial agents and chemotherapy, 63(6), e00594-19. https://doi.org/10.1128/AAC.00594-19
5. Liu, X., Li, R., Zheng, Z., et al. (2017). Molecular Characterization of Escherichia coli Isolates Carrying mcr-1, fosA3, and Extended-Spectrum-β-Lactamase Genes from Food Samples in China. Antimicrobial agents and chemotherapy, 61(6), e00064-17. https://doi.org/10.1128/AAC.00064-17.
6. Nakayama, T., Jinnai, M., Kawahara, R., et al. (2017). Frequent use of colistin-based drug treatment to eliminate extended-spectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli in backyard chicken farms in Thai Binh Province, Vietnam. Tropical animal health and production, 49(1), 31–37.
7. Tijet, N., Faccone, D., Rapoport, M., et al. (2017). Molecular characteristics of mcr-1-carrying plasmids and new mcr-1 variant recovered from polyclonal clinical Escherichia coli from Argentina and Canada. PloS one, 12(7), e0180347. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0180347.
8. Snesrud, E., He, S., Chandler, M., et al. (2016). A Model for Transposition of the Colistin Resistance Gene mcr-1 by ISApl1. Antimicrobial agents and chemotherapy, 60(11), 6973–6976.