Thanh bên bài viết
Số lượt xem PDF: 152
DỰ ĐOÁN KHẢ NĂNG HOÀ TAN VÀ THIẾT KẾ VECTOR BIỂU HIỆN INTERLEUKIN-2 NGƯỜI TRÊN ESCHERICHIA COLI
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Đặt vấn đề: Interleukin-2 (IL-2) đóng vai trò quan trọng trong sự hình thành, phát triển, biệt hóa và cân bằng nội môi của tế bào T đã được FDA chấp thuận cho điều trị ung thư tế bào thận di căn và ung thư hắc tố di căn. Tại Việt Nam hiện nay vẫn phải nhập khẩu nhập IL-2 để điều trị và sử dụng trong nghiên cứu. Mục đích: Dự đoán độ tan của IL-2 người nhằm thiết kế plasmid mang gen tái tổ hợp phù hợp có khả năng biểu hiện IL-2 dạng tan trên Escherichia coli. Phương pháp: Sử dụng ba công cụ dựa trên web gồm SOLart, NetSolP và SoDoPE để dự đoán khả năng tan in silico của IL-2 người và ảnh hưởng của các đuôi dung hợp lên độ tan. Kết quả: Các công cụ đều cho kết quả dự đoán IL-2 người có độ tan ở mức từ trung bình đến kém tan. Trong đó NetSolP cho kết quả khả năng biểu hiện thành công trên E. coli thấp và theo SoDoPE độ tan có thể cải thiện khi gắn thêm các tag như MBP, SUMO. Kết luận: Nghiên cứu đã dự đoán khả năng hoà tan của IL-2 người và đề xuất thiết kế gen tái tổ hợp ở dạng dung hợp với tag SUMO với gen il2 được tối ưu hoá codon để biểu hiện trên E. coli.
Chi tiết bài viết
Từ khóa
: interleukin-2, khả năng hoà tan, SUMO tag
Tài liệu tham khảo
2. Halim S. A., Abdalla O. M., Mesaik M. A. et al. (2013), "Identification of novel Interleukin-2 inhibitors through computational approaches", Molecular diversity. 17(2), pp. 345-355.
3. Hou, Q., Kwasigroch, J. M., Rooman, M., & Pucci, F. (2020). SOLart: a structure-based method to predict protein solubility and aggregation. Bioinformatics, 36(5), 1445-1452.
4. Arkin, M. R., Randal, M., DeLano, W. L., Hyde, J., Luong, T. N., Oslob, J. D.,... & Braisted, A. C. (2003). Binding of small molecules to an adaptive protein–protein interface. Proceedings of the National Academy of Sciences, 100(4), 1603-1608.
5. Thumuluri, V., Martiny, H. M., Almagro Armenteros, J. J., Salomon, J., Nielsen, H., & Johansen, A. R. (2022). NetSolP: predicting protein solubility in Escherichia coli using language models. Bioinformatics, 38(4), 941-946.
6. Bhandari B.K., Lim C.S., Gardner P.P. (2021) “TISIGNER.com: web services for improving recombinant protein production”, Nucleic Acids Research. 49(W1), pp. W654-W661.
7. Costa S. J., Almeida A., Castro A., Domingues L., Besir H. (2012), “The novel Fh8 and H fusion partners for soluble protein expression in Escherichia coli: a comparison with the traditional gene fusion technology”, Applied Microbiology and Biotechnology, 97(15), 6779-6791.
8. Marblestone J. G., Edavettal S. C., Lim Y. et al. (2006), "Comparison of SUMO fusion technology with traditional gene fusion systems: enhanced expression and solubility with SUMO", Protein Science. 15(1), pp. 182-189.